Vücut kitle indeksi (VKİ) ile hem bilinen hem de yeni gen ilişkilerinin tanımlanması, obezitenin biyolojisinin yanı sıra potansiyel biyobelirteçler ve tedavi hedefleri hakkında daha derin bir anlayış sunar.
Biyomedikal Bilişim Departmanından araştırmacılar, çok ırklı bir kohorttan yararlanarak vücut kitle indeksi ile ilişkili gen ifadelerine ilişkin yeni içgörüler ortaya çıkardılar.
Biyomedikal Bilişim Departmanı (DBMI), şurada: Colorado Üniversitesi Tıp Fakültesi, çok ırklı bir kohort kullanan bir çalışma aracılığıyla vücut kitle indeksi (VKİ) ile bağlantılı 45 geni ortaya çıkardı. Bu çalışma, obezite için potansiyel yeni biyobelirteçleri ortaya koymaktadır ve bu genlerin birçoğu daha önce obezite araştırmalarında çalışılmamıştır. Araştırma, 2000 yılında toplanan çeşitli ve kapsamlı bir kohorttan alınan verilerin analiz edilmesiyle gerçekleştirildi.
Baş yazar Luciana Vargas, “Şimdiye kadar, atalardan farklı kohortlarda BMI ile ilgili çok az sayıda genetik çalışma yapıldı” diye açıklıyor. “Çalışmamızın yeniliği, doğrudan ölçülen gen ifadesi verilerinin kullanılmasıdır.”
Vargas, CU Tıp Fakültesi Ph.D. kişiselleştirilmiş tıbba ilgi duyan bir öğrenci, bu bilinen ve yeni gen ilişkilerinin obezitenin biyolojisi, potansiyel biyobelirteçler ve terapötik hedefler hakkında bilgi sağlayabileceğini söylüyor.
Ethan Lange’nin DBMI laboratuvarlarındaki araştırmacılar, yaptıkları çalışma için, Ph.D. ve Leslie Lange, Ph.D., Multi-Ethnic Study of Atherosclerosis (MESA) verilerinden yararlandılar. MESA piyasaya sürüldüğünde, risk faktörlerini ve kardiyovasküler hastalığın erken dönem özelliklerini araştırmak üzere ülke genelindeki altı saha merkezinden toplanan 6.000’den fazla kişiyi kaydettirdi. Katılımcılar, sağlık verilerinin toplanması için periyodik olarak saha merkezlerine bildirimde bulunmaya devam etmektedir. Büyük, etnik olarak çeşitli çalışma popülasyonu ve toplanan sağlık bilgisi miktarı nedeniyle, araştırmacılar verilerini çok sayıda çalışma için kullandılar. 2014 yılında başlatılan Ulusal Kalp, Akciğer ve Kan Enstitüsü tarafından finanse edilen Trans-Omics for Precision Medicine (TOPMed) konsorsiyumu, MESA katılımcılarının bir alt kümesinin yanı sıra diğer pek çok katılımcıdan gen ekspresyonu ve diğer omik verilerini toplamaya başladı. kohortlar.
‘Omics, genler, metabolitler, proteinler ve RNA gibi biyolojik moleküllerdeki ölçülebilir farklılıkları veya değişiklikleri ifade eder.
“MESA kohortunu kullandık çünkü iyi tanımlanmış bir kohort bulmak gerçekten zor. Vargas ile birlikte çalışan bir biyomedikal bilişim araştırma eğitmeni olan Ph.D. DBMI Lange Laboratuvarı.
Araştırmacılar, her birinin ifade ilişkisini değerlendirmek için MESA kohortunda kendilerini tanımlayan dört ırk ve etnik gruptan (Afrikalı Amerikalı, Çinli Amerikalı, Hispanik ve Beyaz) RNA dizileme verilerini analiz ettiler. için gen BMI üzerinde bir etki. Kardiyovasküler riskle ilgili özelliklerin çoğu aynı zamanda obezite ile de ilgilidir ve MESA kohortunu obezite araştırması için ideal kılar.
Tanımladıkları 45 genin, dört grubun tamamında BMI ile ilişkili ifadeleri vardı. Genetik ilişkilendirme çalışmaları yoluyla bu genlerin az bir kısmı tanımlanmış olsa da, CU yazarları pek çok yeni ilişkilendirme bildirdiler.
Konigsberg, çalışmalarının obezite araştırmalarında daha fazla çeşitlilik ihtiyacına işaret ettiğini söylüyor ve bu çalışmanın sonuçlarını bekliyor ek aşağı yönlü çalışmaları bilgilendirmek için. MESA ve ek insan kohortlarını kullanarak araştırmaya devam etmeyi umuyor. Çalışmalarına 2021 Sonbaharında CU Anschutz’da Ph.D. olarak başlayan Vargas için ortak araştırma konusunda değerli bir ders oldu. İnsan Tıbbi Genetiği ve Genomik Programı öğrencisi. Bu, onun bir lisansüstü öğrencisi ve Leslie Lange Lab üyesi olarak ilk makalesi.
“ABD genelinde binlerce kişiyi kaydeden TOPMed konsorsiyumuna dahil olmak, araştırma için yeni fırsatlar yarattı” diyor. “İşbirliğinin gücünü gerçekten takdir ediyorum.”
Referans: “Multi-Ethnic Study of Aterosklerozda vücut kitle indeksi ile gen ifadesi ilişkileri” yazan Luciana B. Vargas, Leslie A. Lange, Kendra Ferrier, François Aguet, Kristin Ardlie, Stacey Gabriel, Namrata Gupta, Joshua D. Smith, Thomas W. Blackwell, Jingzhong Ding, Peter Durda, Russell P. Tracy, Yongmei Liu, Kent D. Taylor, W. Craig Johnson, Stephen S. Rich, Jerome I. Rotter, Ethan M. Lange ve Iain R. Konigsberg, 3 Aralık 2022, International Journal of Obesity.
DOI: 10.1038/s41366-022-01240-x