Bir bilim insanı ekibi, E. coli enfeksiyonlarının kökenini izlemek için yeni bir genomik teknik geliştirdi. ABD’de her yıl 480.000 ila 640.000 idrar yolu enfeksiyonunun gıda kaynaklı E. coli suşlarından kaynaklanabileceğini tahmin ettiler. Gıda kaynaklı E. coli’nin ishale neden olabileceği bilinmekle birlikte, idrar yolu enfeksiyonlarına neden olduğu fikri nispeten yenidir. Çalışma, zararlı E. coli suşlarının gıda hayvanlarından insanlara gıda tedariki yoluyla bulaşarak ciddi hastalıklara neden olduğuna dair güçlü kanıtlar sunuyor.
Yeni bir araştırma, E. coli’nin et ürünlerinden ABD’de her yıl yüzbinlerce idrar yolu enfeksiyonundan sorumlu olabilir.
George Washington Üniversitesi Milken Enstitüsü Halk Sağlığı Okulu’ndan Lance Price ve Cindy Liu liderliğindeki bir bilim insanı ekibi, E. coli enfeksiyonlarının kökenlerini izlemek için yeni bir genomik yaklaşım geliştirdi. Ekip, bu yöntemi kullanarak, Amerika Birleşik Devletleri’nde her yıl 480.000 ila 640.000 idrar yolu enfeksiyonunun gıda kaynaklı E. coli suşlarından kaynaklanabileceğini tahmin etti.
“Gıda kaynaklı E. coli’nin şu fikre alışkınız: ishal salgınlarına neden olabilir, ancak gıda kaynaklı E. coli’nin idrar yolu enfeksiyonlarına neden olduğu kavramı garip görünüyor – yani çiğ etin genellikle bu enfeksiyonlara neden olan E. coli suşları ile dolu olduğunu anlayana kadar,” dedi bir profesör olan Price. çevre ve iş sağlığı uzmanı ve daha önce Kuzey Arizona Üniversitesi’nde araştırmacı olan GW Antibiyotik Direnci Eylem Merkezi’nin yöneticisi. “Çalışmamız, tehlikeli E. coli suşlarının gıda tedariki yoluyla gıda hayvanlarından insanlara geçtiğini ve insanları hasta ettiğini, hatta bazen gerçekten hasta ettiğini gösteren ikna edici kanıtlar sunuyor.”
E. coli, idrar yolu enfeksiyonlarının açık ara en yaygın nedenidir ve her yıl vakaların yüzde 85’inden fazlasına neden olur. Kadınlar, basit mesane enfeksiyonlarından yaşamı tehdit eden kan dolaşımı enfeksiyonlarına kadar değişebilen İYE’lere yakalanma konusunda daha büyük risk altındadır.
Escherichia coli’nin taramalı elektron mikrografı. Kredi: Ulusal Alerji ve Bulaşıcı Hastalıklar Enstitüsü, Ulusal Sağlık Enstitüleri
E. coli, ABD’de eti için yetiştirilen hayvanlar da dahil olmak üzere, insanlarda ve hayvanlarda yaşayabilir ve onları enfekte edebilir. Gıda amaçlı hayvanlar kesildiğinde, bağırsaklarında yaşayan bakteriler (E. coli dahil) et ürünlerini kirletebilir ve insanları maruz kalma riski altına sokabilir.{ 4}
ABD Gıda ve İlaç Dairesi’nden (FDA) elde edilen veriler, çiğ et ürünlerinin çoğunun E. coli ile kontamine olduğunu göstermektedir. Şu anda ABD’de yalnızca E. coli O157:H7 gibi ishale neden olan belirli E. coli türleri ciddi bir şekilde izleniyor, ancak bu yeni araştırma, diğer suşların da ciddi sağlık riskleri oluşturabileceğini gösteriyor.
{ 6}Bu çalışmada araştırmacılar, Flagstaff’taki büyük market zincirlerinden satın alınan çiğ tavuk, hindi ve domuz eti topladılar ve bu et örneklerinden E. coli izole ettiler. Aynı zamanda, NAU’nun Patojen ve Mikrobiyom Enstitüsünde (PMI) çalışırken projeye başlayan araştırmacılar, idrar yolu enfeksiyonları nedeniyle Northern Arizona Healthcare’in Flagstaff Tıp Merkezinde hastaneye kaldırılan hastalardan idrar ve kan E. coli izolatları topladılar.
Araştırma ekibi, etten ve insanlardan alınan E. coli genomlarını analiz ederek, gıda hayvanlarında insanlara karşı kolonize olan suşlara özgü E. coli DNA segmentlerini belirledi ve ardından E. coli’yi diğer insanlardan ayırt etmek için yeni bir öngörü modeli geliştirdi. iki kaynak.
Aynı ekibin tek bir E. coli tipini araştıran
önceki çalışması, kontamine et ile idrar yolu enfeksiyonları arasında bağlantı kurmuştu. Son çalışmada ekip, tüm E. coli dizi türlerine bakmak için yeni öngörü modelini kullandı ve Flagstaff bölgesindeki E. coli idrar yolu enfeksiyonlarının yaklaşık yüzde 8’inin ete atfedilebileceğini gösterdi.
Araştırmacılar, Flagstaff’tan genel olarak ABD nüfusuna ölçeklendirmenin, gıda kaynaklı E. coli’nin ABD’de her yıl yüzbinlerce idrar yolu enfeksiyonuna neden olabileceğini öne sürdüğünü belirtiyor.
“Yoğun gıdaya dayalı bu benzeri görülmemiş çalışma tasarımı Kuzey Arizona Üniversitesi’nde mikrobiyoloji profesörü ve çalışmanın ortak yazarı Paul Keim, izole bir topluluğun örneklenmesi ve baskın sağlık hizmeti sağlayıcısının katılımı, halk sağlığı araştırmalarına güçlü bir yaklaşımdır” dedi. “Genomik teknolojilerdeki gelişmelerle birlikte çalışma tasarımı, gıda kaynakları ile klinik vakalar arasında bağlantılar kurmamızı sağladı. Bu model durumundan çıkacak sonuçlar, dünya çapındaki halk sağlığı uygulamalarını etkileyecek.”
Mevcut çalışmada tanımlanan gıda kaynaklı E. coli suşları yalnızca idrar yolu enfeksiyonlarıyla ilişkili değildi, aynı zamanda ciddi böbrek ve kan dolaşımı enfeksiyonlarına da neden olabiliyordu. . Kontrol edilmediği takdirde, E. coli kan dolaşımı enfeksiyonları ölümcül olabilir. ABD’de her yıl 36.000 ila 40.000 kişinin E. coli kan dolaşımı enfeksiyonlarından öldüğü tahmin edilmektedir, ancak şu anda bunların ne kadarının gıda kaynaklı maruziyetlerden kaynaklandığı bilinmemektedir.
“İnsanlar genellikle mesane enfeksiyonlarını şu şekilde göz ardı etmektedir: GW Antibiyotik Direnci Eylem Merkezi çevre ve iş sağlığı yardımcı profesörü ve PMI’da eski araştırmacı olan Liu, küçük rahatsızlıklar, ancak mesane hastaların böbreklerine ve kan dolaşımına giden önemli bir geçittir” dedi. “55 yaş üstü kişiler ve kanser ve organ nakli hastaları gibi savunmasız popülasyonlar, yaşamı tehdit eden kan enfeksiyonları açısından en yüksek risk altındadır, ancak genç, sağlıklı insanlar da risk altındadır.”
Çalışma, üreticilerin ve FDA’nın Gıdalardaki potansiyel olarak tehlikeli patojenleri, özellikle de ülke çapındaki marketlerde satılan çiğ etleri izleme konusunda daha iyi bir iş yapın. Aynı zamanda, tüketiciler kontamine gıdalara maruz kalmalarını sınırlamak için adımlar atabilirler. Yazarlar, örneğin, ev aşçılarının çiğ eti hazırlarken veya tutarken ellerini dikkatli bir şekilde yıkaması ve çiğ ve pişmiş yiyecekleri hazırlamak için ayrı yüzeyler kullanması gerektiğini söylüyor.
Çalışma, “Tanımlamak için kaynağa bağlı mobil genetik öğelerin kullanılması zoonotik ekstraintestinal E. coli enfeksiyonları”, One Health dergisinde 23 Mart’ta çevrimiçi olarak yayınlandı. GW ekibi, bu makale üzerinde işbirliği yapan çok merkezli bir araştırmacı grubuna liderlik etti. Kuzey Arizona Üniversitesi, E. coli suşu işleme ve genom dizilimi üzerinde işbirliği yaparken, UTI E. coli, eski laboratuvar yöneticisi Lori Gauld liderliğindeki Flagstaff Tıp Merkezi’ndeki klinik mikrobiyoloji ekibi tarafından toplandı. Kaynak sonuçlarına götüren biyoinformatik analiz GW’de yapılmıştır.
Referans: “Zoonotik ekstraintestinal E. coli enfeksiyonlarını tanımlamak için kaynakla ilişkili mobil genetik elementlerin kullanılması”, yazan Cindy M. Liu, Maliha Aziz, Daniel E. Park , Zhenke Wu, Marc Stegger, Mengbing Li, Yashan Wang, Kara Schmidlin, Timothy J. Johnson, Benjamin J. Koch, Bruce A. Hungate, Lora Nordstrom, Lori Gauld, Brett Weaver, Diana Rolland, Sally Statham, Brantley Hall, Sanjeev Sariya, Gregg S. Davis, Paul S. Keim, James R. Johnson ve Lance B. Price, 28 Şubat 2023, Tek Sağlık.
DOI: 10.1016/j.onehlt.2023.100518
Çalışma GW, NAU, Wellcome Trust, Ulusal Sağlık Enstitüleri ve Cowden Endowment for Food Microbiology tarafından desteklenmiştir.