Çığır açan bir çalışma, 5.242 türü kapsayan en kapsamlı kurbağa evrim ağacını sunuyor. Araştırma, kurbağa evrimi için gözden geçirilmiş bir zaman çizelgesi öneriyor ve diğer organizmalara uygulanabilir içgörüler ve metodolojiler sunan yenilikçi bir yazılım sunuyor. Bu fotoğrafta bir Vietnam Yosunlu Kurbağası (Theloderma corticale) gösterilmektedir.
Kurbağaların bugüne kadarki en ayrıntılı ve kapsamlı aile ağacı, moleküler veriler kullanılarak oluşturulmuştur.
Araştırmacılar, Aralarında Londra Doğa Tarihi Müzesi Amfibiler ve Sürüngenler Kıdemli Küratörü Jeff Streicher’in de bulunduğu ekip, kurbağaların (anuran amfibiler) bugüne kadarki en kapsamlı evrim ağacını ortaya çıkardı. Yüzlerce genetik işarete ve şaşırtıcı 5.242 kurbağa türüne dayanan bu kapsamlı filogeni, bu büyüleyici yaratıklara ilişkin anlayışımızı değiştirecek.
Evrimsel Zaman Çizelgesinde Değişim
Yeni araştırmalar da değişti Yaşayan kurbağaların evrimleşmeye başladığı olası başlangıç tarihi. Makalenin başyazarı Jeff Streicher’e göre, “Daha önce grubun yaklaşık 210 veya 220 milyon yıl önce bugün gördüğümüz binlerce türe bölünmeye başladığı düşünülüyordu. Yeni analizimiz bu tarihin yaklaşık 180 milyon yıl önce olduğunu öne sürüyor. Kurbağaların daha genç olduğunun ortaya çıkması, onların daha önce düşünüldüğünden daha hızlı bir şekilde binlerce türe çeşitlendiği anlamına geliyor.”
Kurbağalar, çeşitli doğal geçmişleriyle, hem biyologlar hem de doğa meraklıları için her zaman hayranlık uyandıran bir konu olmuştur. Ancak, bu canlılar için kapsamlı filogeniler oluşturmaya yönelik önceki girişimler, kullanılan genetik veri türleriyle sınırlıydı.
Çalışmadaki Metodolojik Gelişmeler
Bu çalışmada araştırmacılar, kapsamlı bir araştırma geliştirerek bu sınırlamaları ele aldı. Filogenomik çalışmalardan elde edilen genetik verileri, yalnızca birkaç türü içeren yüzlerce genetik işaretleyiciyle ve bazen yalnızca bir veya iki işaretleyici kullanan ancak toplu olarak binlerce türü içeren yüzlerce küçük ölçekli kurbağa çalışmalarından elde edilen verilerle birleştiren aile ağacı. Bu yeni yaklaşım, şaşırtıcı bir şekilde 5.242 kurbağa türünü dahil etmelerine olanak sağladı; bu, önceki aile ağaçlarına kıyasla %71’lik kayda değer bir artışı temsil ediyor.
Jeff Streicher şöyle diyor: “Filogenetik ağaçlar, belirli bir kurbağa grubunu inceleyen çoğu çalışmanın başlangıç noktasıdır. Bu yüzden mümkün olduğu kadar doğru ve ayrıntılı olmaları çok önemli.”
Başyazar Dan Portik şunu ekliyor: “Burada yalnızca kurbağa filogenetik ağacının yararlandığı verileri artırmakla kalmadık, aynı zamanda yeni özellikler de geliştirdik. bu verileri iyileştirmeye yardımcı olacak bir yazılım.”
Yazılım Yenilikleri ve Gelecekteki Uygulamalar
Araştırmacılar, türler arasında büyük farklılıklar geliştiren genleri karşılaştırmayı kolaylaştırmak için yazılım geliştirdiler.
John Kıdemli yazar ve Arizona Üniversitesi Profesörü J. Wiens şunları söylüyor: “Önceki çalışmalar, yüzlerce işaretleyiciden oluşan filogenomik veri kümelerini, daha az işaretleyiciye sahip birçok küçük çalışmadan elde edilen verilerle birleştirmekten korkuyordu. Bunun sadece mümkün olmadığını, aynı zamanda binlerce türü içerebilecek gelişmiş bir aile düzeyinde ağaca da yol açtığını gösterdik. Aynı yaklaşım herhangi bir organizma grubuna da uygulanabilir.”
Sonuç ve Geleceğe Yönelik Çıkarımlar
Çalışma, kurbağa evrimi anlayışımızda önemli bir ilerlemeyi temsil ediyor ve araştırmacılar ve araştırmacılar için değerli bir kaynak sağlıyor. Anuran amfibilerinin incelenmesi için yeni yollar sunuyor. Bilim topluluğu bu olağanüstü canlılara ilişkin bilgimizi keşfetmeye ve genişletmeye devam ettikçe, bu kapsamlı filogeni gelecekteki keşifler için bir temel görevi görüyor.
Referans: “Kurbağa soyoluş: zaman ayarlı, tür düzeyinde bir ağaç yüzlerce lokus ve 5.242 tür”, Daniel M. Portik, Jeffrey W. Streicher ve John J. Wienss, 25 Ağustos 2023, Moleküler Filogenetik ve Evrim.
DOI: 10.1016/j.ympev.2023.107907