1348 ve 1349’da toplu mezarlar için kullanılan Doğu Smithfield veba çukurları. Kredi: Londra Arkeoloji Müzesi (MOLA)
Araştırmacılar 600’den fazla genomu analiz etti vebaya neden olan bakteri Yersinia pestis’in dizilimleri.
Hıyarcıklı vebanın kökenleri ve tarih boyunca yayılması hakkında daha derin bilgiler edinme çabasıyla, McMaster Üniversitesi, Sidney Üniversitesi ve Üniversite’den araştırmacılar of Melbourne, yüzlerce modern ve eski genom dizisinin kapsamlı ve ayrıntılı bir analizini yaparak türünün en büyük araştırmasını oluşturdu.
DNA teknolojisi ve analizindeki önemli gelişmelere rağmen, DNA’nın kökeni, evrimi ve yayılması vebanın tam yerini saptamak hâlâ zordur.
Veba, insanlık tarihindeki en büyük ve en ölümcül iki pandemiden sorumludur. Bununla birlikte, bunların gelgitleri, neden bazılarının yok olup diğerlerinin yıllarca devam etmesi bilim adamlarının kafasını karıştırdı.
Bugün Communications Biology dergisinde yayınlanan bir makalede, McMaster araştırmacıları kapsamlı veriler ve analizler kullanarak ortaya koydukları şeyi çizelge haline getiriyor. vebaya neden olan bakteri Y. pestis’in son derece karmaşık geçmişi hakkında bilgi verebilir.
Araştırma, vebanın 5.000 yıl önce insanlarda ilk ortaya çıkışını kapsayan, dünyanın dört bir yanından 600’den fazla genom dizisinin bir analizini içeriyor. Justinianus vebası, Orta Çağ Kara Ölümü ve 20. yüzyılın başlarında başlayan mevcut (veya üçüncü) Pandemi.
Ayin için kullanılan Doğu Smithfield veba çukurları 1348 ve 1349’daki mezarlar. Kredi: Londra Arkeoloji Müzesi (MOLA)
“Veba, insanlık tarihindeki en büyük salgın ve en büyük ölüm olayıydı. Ne zaman ortaya çıktığı ve hangi konakçının nereden geldiğine, neden yüzlerce yıl boyunca sürekli olarak patlak verdiğine ve bazı yerlerde yok olurken diğerlerinde neden devam ettiğine ışık tutabilir. McMaster’ın Antik DNA Merkezi yöneticisi evrimsel genetikçi Hendrik Poinar, “Sonuçta neden bu kadar çok insanı öldürdü” diye açıklıyor.
Poinar, Michael G. DeGroote Bulaşıcı Hastalık Araştırma Enstitüsü ve McMaster’ın Global Nexus’unda baş araştırmacıdır. için. Bu, mutasyonların zaman içinde genomunda birikme hızını ölçmeyi özellikle zorlaştırır ve bunlar daha sonra ortaya çıkma tarihlerini hesaplamak için kullanılır.
Y. pestis çok yavaş bir hızda geliştiği için, bunu yapmak neredeyse imkansızdır. tam olarak nereden kaynaklandığını belirlemek için.
İnsanlar ve kemirgenler, patojeni seyahat ve ticaret yoluyla dünyanın dört bir yanına taşıyarak, genomunun evrimleşmesinden daha hızlı yayılmasını sağladı. Yıllarla ayrılmış olmasına rağmen Rusya, İspanya, İngiltere, İtalya ve Türkiye’de bulunan genomik dizilerin tümü aynıdır; örneğin, bulaşma yolunun belirlenmesinde büyük zorluklar yaratmaktadır.
Sorunu çözmek için araştırmacılar, Y. pestis’in belirli popülasyonlarını ayırt etmek için yeni bir yöntem, onların tarih boyunca beş popülasyonu tespit etmelerini ve tarihlendirmelerini sağlıyor; şu anda tahmin ettikleri en ünlü antik pandemi soyları, pandeminin Avrupa’da tarihsel olarak belgelenmesinden on yıllar hatta yüzyıllar önce ortaya çıktığını tahmin ediyorlar.{ 4}
“Vebayı tek bir bakteri olarak düşünemezsiniz” diye açıklıyor Poinar. “Verilerimiz ve analizlerimizin gösterdiği gibi bağlam son derece önemlidir.”
Geçmişimizin, günümüzün ve geleceğimizin pandemilerini doğru bir şekilde yeniden oluşturmak için tarihsel, ekolojik, çevresel, sosyal ve kültürel bağlamlar da eşit derecede önemlidir.
Genetik kanıtların, kısa süreli veba salgınlarının zamanlamasını ve yayılmasını yeniden yapılandırmak için tek başına yeterli olmadığını, bunun geçmiş salgınlarla ilgili gelecekteki araştırmalar ve COVID-19 gibi devam eden salgınların ilerlemesi için etkileri olduğunu açıklıyor.
Referans: “Kriptik bir saat tarafından rahatsız edildi: Yersinia pestis’in küresel soyoluşundan içgörü ve sorunlar” yazan Katherine Eaton, Leo Featherstone, Sebastian Duchene, Ann G. Carmichael, Nükhet Varlık, G. Brian Golding, Edward C. Holmes ve Hendrik N. Poinar, 19 Ocak 2023, Communications Biology.
DOI: 10.1038/s42003-022-04394-6